本站自清朝政府統治之際，由巡撫劉銘傳所創設，光緒13年（1887年）4月28日基隆-台北間鐵路開工，於光緒17年（1891年）完成28.6公里，共設六個車站，當年成立水返腳站（汐止站），並開始營業。

　　本站原址汐止市信望里信義路一號，距基隆站13.1公里，距台北站15.5公里，位居汐止中心地區。

　　此地自古以來就以「峰峙灘音」（是指流經此地基隆河沿岸所具有獨特的美妙景觀）而得名，是台北近郊的休閒勝地，如能悠遊一日有許多值得觀賞徘徊的風味。

　　因應中山高、北二高、新台五路相繼通車，逐漸帶來市區開發與繁榮，人口增加對本路客運運能需求日增，本站於民國87年12月1日調整為二等站，並於民國88年2月、3月間分別完成自動售票機及電腦連線售票營運。

　　民國91年7月配合【南港專案】舊站拆除、遷移臨時站，先期停辦行包託運業務，俟高架車站通車營運後恢復。民國91年10月遷移至臨時站起，即正式展開高架車站基礎開挖、土木興建等工程，歷時約三年六月，終於在95年4月9日正式完工啟用。