鶯歌站於民國前十年（明治三十四年）八月二十五建站，古稱為鷹哥石驛，是為木造站房。日據時代稱鶯歌石驛，站址在車站西方約四百公尺處（現鶯歌派出所對面）。嗣因鶯歌～桃園間路線坡度太陡，民國十一年建迂迴尖山至桃園新線，五月十六日遷移舊站址。民國十二年為運輸需要，增設第三股道，民國十三年再設石碴線，民國十五年又設貨物第一、二股道。並增設裝煤線一股。啟用跨站臨時天橋，同時封閉地下道。民國十九年因台北至竹南及台南至高雄間改複線運轉，並增設裝煤線一股。民國五十五年因木造車站，蟲蛀腐朽，不堪使用，車站改建為水泥站房，民國七十四年增設中興一號專用側線。民國八十九年為配合當地陶瓷觀光，繁榮地方及業務成長需要改建新站，啟用跨站臨時天橋，同時封閉地下道，新站於民國九十二年一月二十四日落成啟用。

鶯歌地名出自鶯歌山，在鶯歌山山腰部有一巨岩，遠望酷似鶯歌，居民皆稱之鶯歌石，久之鶯歌石即變成地名。乘上行列車坐於左側位憑窗向前遠眺，即可看到酷似鶯歌之鶯歌石。